Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Vmn1r29Q9EQ41 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Vmn1r29Q9EQ41 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Vmn1r29Q9EQ41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Vmn1r29Q9EQ41 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Vmn1r29Q9EQ41 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Vmn1r29Q9EQ41 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Vmn1r29Q9EQ41 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Vmn1r29Q9EQ41 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r29Q9EQ41 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Vmn1r29Q9EQ41 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r29Q9EQ41 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r29Q9EQ41 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r29Q9EQ41 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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