Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyp27a1Q9DBG1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp27a1Q9DBG1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp27a1Q9DBG1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms