Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Subh2bvQ9D9Z7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Subh2bvQ9D9Z7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Subh2bvQ9D9Z7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms