Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Llcfc1Q9D9P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Llcfc1Q9D9P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Llcfc1Q9D9P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Llcfc1Q9D9P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.5 ms