Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm5Q9D806 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm5Q9D806 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm5Q9D806 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms