Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med8Q9D7W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med8Q9D7W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms