Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc94Q9D6J3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc94Q9D6J3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms