Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata1Q9D5R4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata1Q9D5R4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata1Q9D5R4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms