Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D1K7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D1K7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D1K7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D1K7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D1K7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D1K7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms