Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ankrd1Q9CR42 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd1Q9CR42 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.8 ms