Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms