Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NelfcdQ922L6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfcdQ922L6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfcdQ922L6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms