Protein–RNA interactions for Protein: Q91V17

Znrf1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf1Q91V17 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znrf1Q91V17 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znrf1Q91V17 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znrf1Q91V17 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms