Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps4aQ8VEJ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps4aQ8VEJ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps4aQ8VEJ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms