Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nupl2Q8CIC2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nupl2Q8CIC2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nupl2Q8CIC2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms