Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4932414N04RikQ8CEQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4932414N04RikQ8CEQ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4932414N04RikQ8CEQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4932414N04RikQ8CEQ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms