Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930507D05RikQ8C9C9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930507D05RikQ8C9C9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms