Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol9bQ8C7I4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol9bQ8C7I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9bQ8C7I4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol9bQ8C7I4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms