Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spock3Q8BKV0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spock3Q8BKV0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms