Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FtoQ8BGW1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FtoQ8BGW1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FtoQ8BGW1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 717.9 ms