Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SugctQ7TNE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SugctQ7TNE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SugctQ7TNE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SugctQ7TNE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms