Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmc8Q7TN58 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmc8Q7TN58 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms