Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dhx40Q6PE54 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dhx40Q6PE54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dhx40Q6PE54 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms