Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa17Q64016 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa17Q64016 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa17Q64016 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms