Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd180Q62192 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd180Q62192 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd180Q62192 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd180Q62192 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms