Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo39Q5NBU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo39Q5NBU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo39Q5NBU5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms