Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Otol1Q4ZJM7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms