Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms