Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnpc3Q3UZ01 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnpc3Q3UZ01 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms