Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc34Q3UI66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc34Q3UI66 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms