Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srebf2Q3U1N2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srebf2Q3U1N2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srebf2Q3U1N2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srebf2Q3U1N2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms