Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tatdn3Q3U1C6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tatdn3Q3U1C6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tatdn3Q3U1C6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms