Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KhsrpQ3U0V1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KhsrpQ3U0V1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms