Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd33bQ3U0L2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd33bQ3U0L2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd33bQ3U0L2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms