Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc13Q3TIR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc13Q3TIR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms