Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp444Q3TDV8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zfp444Q3TDV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfp444Q3TDV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms