Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Jmjd8Q3TA59 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Jmjd8Q3TA59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms