Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ptchd1Q14B62 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ptchd1Q14B62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ptchd1Q14B62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ptchd1Q14B62 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms