Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp4r2Q0VGB7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp4r2Q0VGB7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp4r2Q0VGB7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp4r2Q0VGB7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms