Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AmbpQ07456 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmbpQ07456 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms