Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PlnP61014 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PlnP61014 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PlnP61014 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PlnP61014 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PlnP61014 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PlnP61014 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PlnP61014 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PlnP61014 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PlnP61014 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PlnP61014 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PlnP61014 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PlnP61014 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PlnP61014 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PlnP61014 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PlnP61014 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PlnP61014 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PlnP61014 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PlnP61014 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PlnP61014 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PlnP61014 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PlnP61014 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PlnP61014 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PlnP61014 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms