Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CgnP59242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CgnP59242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CgnP59242 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CgnP59242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CgnP59242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CgnP59242 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CgnP59242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CgnP59242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CgnP59242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CgnP59242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CgnP59242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CgnP59242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CgnP59242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CgnP59242 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CgnP59242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CgnP59242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CgnP59242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CgnP59242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CgnP59242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CgnP59242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CgnP59242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CgnP59242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CgnP59242 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CgnP59242 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CgnP59242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CgnP59242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CgnP59242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CgnP59242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CgnP59242 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CgnP59242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CgnP59242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CgnP59242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CgnP59242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CgnP59242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CgnP59242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CgnP59242 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CgnP59242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CgnP59242 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CgnP59242 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CgnP59242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CgnP59242 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CgnP59242 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CgnP59242 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CgnP59242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CgnP59242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CgnP59242 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CgnP59242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CgnP59242 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CgnP59242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CgnP59242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CgnP59242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CgnP59242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CgnP59242 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CgnP59242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CgnP59242 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CgnP59242 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CgnP59242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CgnP59242 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CgnP59242 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CgnP59242 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CgnP59242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CgnP59242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms