Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa6P50704 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa6P50704 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa6P50704 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa6P50704 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.9 ms