Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt6aP50446 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt6aP50446 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt6aP50446 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt6aP50446 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms