Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmx2P43687 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmx2P43687 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmx2P43687 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms