Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab20P35295 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab20P35295 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab20P35295 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab20P35295 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms