Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp42P22227 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp42P22227 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms