Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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Hoxb1P17919 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxb1P17919 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxb1P17919 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb1P17919 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hoxb1P17919 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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