Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou4f1P17208 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f1P17208 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pou4f1P17208 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f1P17208 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms