Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ass1P16460 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ass1P16460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ass1P16460 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ass1P16460 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ass1P16460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ass1P16460 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms